根据微生物特性进行分析
通过对分段样品点检测获得异常点后，我们需适当根据微生物污染的种类进行分析以缩小范围。
当细菌总数不正常时，我们可以根据细菌的特性，如在水、营养、空气和合适的温度下，细菌就会生长，菌落总数就会增加。因此一些不容易清洗干净的地方，例如管道死角，就是需要重点关注的区域。
而对于大肠菌群，大肠菌为兼性厌氧菌，最适生长温度为30 ℃~37 ℃，在肠道粪便、土壤、被污染的水和植物上都能发现大肠菌。食品大肠菌可作为常规细菌质量控制的卫生指标，当巴氏杀菌后在管道内发现大肠菌，这意味着有可能是二次污染，即常规清洗和消毒方法需要改善。此外，我们还需要关注水资源是否被人畜粪便所污染，员工是否按照卫生规定便后洗手等。
同样的，当霉菌等微生物异常时，阴暗潮湿的角落就将成为是我们的关注重点。
根据工艺特性分析
食品生产过程中常常有搅拌，加热，冷却等步骤。在分析异常时，可以将食品生产过程适当分为热处理步骤、常温步骤等。
在生产整个阶段，常温步骤较容易引起微生物生长繁殖。在此阶段的产品，不宜在常温阶段存留时间过长，否则容易引起微生物繁殖，导致控制困难。因此，在进行分析时， 常温阶段的步骤是分析的重点。
而对于加热的步骤，一般有使微生物减少的作用，且加热步骤通常放置在整个生产工艺的末尾，起到杀菌作用，在人员按作业指导书进行操作的前提下，不大可能会成为微生物污染的关键点。
日常监测的重要性
在生产过程中建立合适的监测点是日常生产质量控制的一种方法，这也是在线质量控制的要求。
因此认真策划选取生产流程上的监测点十分重要：
选取的点能代表生产线生产步骤的关键控制点，达到质量控制的目的。
考虑品控人员的工作量，成为有效的日常在线监控手段。
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